蒙城縣城區(qū)現有污水處理廠兩座，其中蒙城縣清流污水處理廠位于老城區(qū)東側，建設規(guī)模3萬噸/日，2005年開工建設，2007年8月建成運行，2011年完成除磷脫氮技術改造，主要收集處理老城區(qū)約10.2平方公里范圍內的生活污水；蒙城縣污水處理二廠位于城南經濟開發(fā)區(qū)柳林路與莊子大道交叉口，一期工程2.5萬噸/日規(guī)模于2012年4月開工建設，2013年8月建成運行并通過環(huán)保竣工驗收，主體工藝采用卡魯塞爾2000型氧化溝+絮凝沉淀活性砂過濾工藝，剩余污泥采用板框式壓濾方式，主要收集處理鯤鵬路以南城南新區(qū)及道口工業(yè)園區(qū)范圍內的生活污水和部分工業(yè)污水。

截止到2014年底，蒙城縣城區(qū)污水管網總里程已達到200公里，管網已覆蓋整個城市規(guī)劃區(qū)，城市新區(qū)已全部實現雨污分流管網，老城區(qū)正在進行雨污分流管網改造。蒙城縣老城區(qū)污水收集系統(tǒng)部分區(qū)域采用雨污合流管網，部分新修改造路段采用雨污分流制。

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